Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF3P61204 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms