Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BGRP55822 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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