Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRA4P48169 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms