Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR4A2P43354 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms