Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms