Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHCEP18577 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHCEP18577 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHCEP18577 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHCEP18577 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHCEP18577 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms