Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COCHO43405 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COCHO43405 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COCHO43405 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms