Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4E171 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4E171 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4E171 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms