Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4Q9P0V3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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