Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASCL3Q9NQ33 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms