Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SH3GL3Q99963 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms