Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCMH1Q96GD3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCMH1Q96GD3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms