Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFT2D3Q587I9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SFT2D3Q587I9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms