Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN52Q52LA3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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