Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMCO1Q147U7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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