Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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BNIP1Q12981 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNIP1Q12981 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms