Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPZ1P61923 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms