Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGCP20142 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGCP20142 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGCP20142 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms