Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAVP06756 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms