Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms