Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPRHQ9HD43 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRHQ9HD43 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms