Protein–RNA interactions for Protein: Q494W8

CHRFAM7A, CHRNA7-FAM7A fusion protein, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRFAM7AQ494W8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CHRFAM7AQ494W8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRFAM7AQ494W8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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