Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYPL1Q16563 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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