Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPEGQ15772 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms