Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSHL1Q14406 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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