Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMAD4Q13485 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMAD4Q13485 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms