Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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STX4Q12846 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms