Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms