Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF9Q00978 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IRF9Q00978 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms