Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms