Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTX3P26022 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms