Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
PDE6GP18545 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PDE6GP18545 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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PDE6GP18545 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
PDE6GP18545 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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