Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCF2Q9UG63 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms