Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNTG1Q9NSN8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms