Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSF3RQ99062 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms