Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJA4Q8WW22 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms