Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF182Q8N6D2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms