Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATG16L1Q676U5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG16L1Q676U5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms