Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP1A4Q13733 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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