Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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PTPN13Q12923 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PTPN13Q12923 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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