Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
HERVK_113P61574 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms