Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB28P51157 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB28P51157 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB28P51157 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms