Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIA3P42263 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms