Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms