Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCAP17252 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKCAP17252 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms