Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFS4O43181 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms