Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ACAP3-207ENST00000470659 421 ntTSL 315.84■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CALCOCO1-203ENST00000546443 1523 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.055e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 215.22■□□□□ 0.035e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-210ENST00000481355 466 ntTSL 315.06■□□□□ 05e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -05e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CXXC1-215ENST00000591190 1021 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-201ENST00000403969 1360 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-214ENST00000557437 575 ntTSL 414.23□□□□□ -0.135e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 514.17□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-202ENST00000404006 2201 ntTSL 1 (best)14.05□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 FBRS-204ENST00000482749 725 ntTSL 514.01□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 213.91□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.212e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ST6GALNAC6-213ENST00000494541 712 ntTSL 313.48□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 513.44□□□□□ -0.265e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-212ENST00000556092 571 ntTSL 413.42□□□□□ -0.265e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-211ENST00000477090 566 ntTSL 413.23□□□□□ -0.295e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-260ENST00000556974 1012 ntTSL 513.17□□□□□ -0.35e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-265ENST00000557182 559 ntTSL 413.15□□□□□ -0.35e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 DIP2A-206ENST00000472364 2542 ntTSL 212.8□□□□□ -0.365e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-225ENST00000554094 595 ntTSL 512.75□□□□□ -0.375e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-223ENST00000553867 848 ntTSL 512.74□□□□□ -0.375e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-259ENST00000556924 603 ntTSL 412.73□□□□□ -0.375e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 512.48□□□□□ -0.415e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 MAFK-203ENST00000406174 632 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 DIP2A-211ENST00000481883 3119 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.495e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-210ENST00000471244 3632 ntTSL 211.6□□□□□ -0.555e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 NDRG2-218ENST00000553593 978 ntTSL 311.44□□□□□ -0.585e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-208ENST00000438649 1901 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-246ENST00000555695 823 ntTSL 511.12□□□□□ -0.635e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-214ENST00000553442 639 ntTSL 511.08□□□□□ -0.645e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 DGKG-205ENST00000447054 295 ntTSL 310.92□□□□□ -0.665e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 NDRG2-210ENST00000397856 1309 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.685e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-248ENST00000555767 560 ntTSL 410.75□□□□□ -0.695e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-277ENST00000557728 587 ntTSL 210.59□□□□□ -0.715e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.725e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.735e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-240ENST00000555026 1162 ntTSL 510.41□□□□□ -0.745e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-219ENST00000553741 842 ntTSL 210.3□□□□□ -0.765e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 CALCOCO1-210ENST00000548263 3888 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.835e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CPSF7-221ENST00000543545 495 ntTSL 59.8□□□□□ -0.845e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 SH2B1-207ENST00000561629 613 ntTSL 29.38□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RERE-214ENST00000488215 962 ntTSL 39.32□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 10.8
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PRPF4O43172 RNF216P1-204ENST00000405396 899 ntTSL 39.01□□□□□ -0.975e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.985e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 28.77□□□□□ -1.015e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-264ENST00000557169 851 ntTSL 28.68□□□□□ -1.025e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-253ENST00000556366 772 ntTSL 58.34□□□□□ -1.075e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-207ENST00000470990 2138 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.15e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-213ENST00000449431 545 ntTSL 48.13□□□□□ -1.115e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-228ENST00000554277 410 ntTSL 58.07□□□□□ -1.125e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-208ENST00000464479 525 ntTSL 48.05□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 47.41□□□□□ -1.225e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-209ENST00000425775 527 ntTSL 47.39□□□□□ -1.235e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-236ENST00000554531 669 ntTSL 47.25□□□□□ -1.255e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 37.03□□□□□ -1.285e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-205ENST00000366204 572 ntTSL 46.34□□□□□ -1.395e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-262ENST00000557149 583 ntTSL 26.2□□□□□ -1.425e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 36.1□□□□□ -1.435e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 45.89□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 45.84□□□□□ -1.475e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 MAGI1-215ENST00000496734 589 ntTSL 25.56□□□□□ -1.525e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 RNF216P1-206ENST00000406608 576 ntTSL 45.4□□□□□ -1.545e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-210ENST00000555425 547 ntTSL 54.6□□□□□ -1.675e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 SEC23A-208ENST00000555017 588 ntTSL 43.02□□□□□ -1.935e-11■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ANG-203ENST00000554073 251 ntTSL 32.95□□□□□ -1.942e-8■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 AC007388.1-211ENST00000451547 329 ntTSL 52.6□□□□□ -1.995e-6■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-210ENST00000488485 1884 ntTSL 216.33■□□□□ 0.213e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.063e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.053e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 514.45□□□□□ -0.13e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-208ENST00000481472 411 ntTSL 414.38□□□□□ -0.113e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.183e-9■□□□□ 10.8
PRPF4O43172 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.333e-9■□□□□ 10.8
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