Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM3Q9BZL3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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