Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SNHG12Q9BXW3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms