Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATA5Q9BWX5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms